একটি ভালো কলেজ শুধু শিক্ষার্থীদের বোর্ড পরীক্ষায় ভালো ফলাফল প্রদান করেই ক্ষান্ত হয় না; বরং অন্যান্য শিক্ষাপ্রতিষ্ঠানের জন্য অনুকরণীয়ও হতে পারে। নটর ডেম কলেজের ভালো বৈশিষ্ট্যগুলো অনেক কলেজ শুধু নয়; বরং অনেক বিশ্ববিদ্যালয়ও অনুকরণ করে শিক্ষার মানোন্নয়ন সাধন করছে। এই কলেজের অন্যতম বৈশিষ্ট্য হলো বহুমাত্রিক ক্লাব। কলেজে শিক্ষার্থী দ্বারা পরিচালিত প্রায় ২৫ থেকে ২৬টি ক্লাব রয়েছে, যার মাধ্যমে প্রতিটি শিক্ষার্থীর নেতৃত্ব বিকাশে বিশেষ ভূমিকা পালন করে থাকে। এসব সাংগঠনিক প্রতিষ্ঠানের মধ্যে রয়েছে নটর ডেম বিজ্ঞান ক্লাব, নাট্যদল, বিজনেস ক্লাব, নেচার ক্লাব, চেস ক্লাব, অ্যাডভেঞ্চার ক্লাব, বিজনেস ক্লাব, মানবিক সংঘ, নেচার স্টাডি ক্লাব, ডিগ্রি ক্লাব, যুব রেড ক্রিসেন্ট, রোটার্যাক্ট ক্লাব অব নটর ডেম কলেজ, নাট্যদল, নটর ডেম ইকো অ্যান্ড স্পেস ক্লাব, ইন্টারন্যাশনাল আউটস্ট্যান্ডিং অ্যান্ড রিলেশনশিপ ক্লাব, সাংস্কৃতিক ক্লাব, নটর ডেম ইংলিশ ক্লাব, এথিকস ক্লাব, ফটোগ্রাফি ক্লাব, নটর ডেম আইটি ক্লাব ইত্যাদি।
এর মধ্যে ভারতীয় উপমহাদেশের প্রথম বিজ্ঞান ক্লাব কেন্দ্র হলো রিচার্ড উইলিয়াম টিমের প্রতিষ্ঠিত নটর ডেম সায়েন্স ক্লাব। নটর ডেম ইংলিশ ক্লাবকেও বাংলাদেশে প্রথমই বলা যায়। এ ছাড়া বিতর্কচর্চাবিষয়ক বাংলাদেশের প্রথম প্রাতিষ্ঠানিক ক্লাব হলো নটর ডেম ডিবেটিং ক্লাব। এসব ক্লাবের মাধ্যমে নটর ডেমের শিক্ষার্থীকে সাংগঠনিকভাবে দক্ষ ও পরমতসহিষ্ণু করা হয়। তা ছাড়া দেশ–বিদেশে বিভিন্ন অলিম্পিয়াডে এ কলেজের ছাত্ররা অত্যন্ত মেধার স্বাক্ষর রেখে চলেছে।
